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| 1983年（昭和58年） | 7月1日 | 日本エアコミューター株式会社設立（本社：奄美空港内） |
| 11月2日 | 不定期航空運送事業の免許取得 | |
| 12月10日 | ドルニエ228型機で運航開始（奄美大島と喜界島・徳之島・沖永良部・与論島を結ぶ4路線） | |
| 1987年（昭和62年） | 12月16日 | 航空機使用事業免許取得 |
| 1988年（昭和63年） | 5月31日 | 奄美格納庫竣工 |
| 6月15日 | 本社機構を鹿児島空港内に移転 | |
| 7月6日 | 定期航空運送事業の免許取得 | |
| 7月19日 | 鹿児島〜沖永良部線運航開始（YS-11による初の定期路線運航） | |
| 10月14日 | 資本金を3億円に増資 | |
| 1992年（平成4年） | 8月20日 | 格納庫、トレーニングセンター竣工 |
| 10月1日 | SAAB340B型機1号機 鹿児島〜松山・鹿児島〜大分・宮崎〜松山・宮崎〜長崎の4路線に就航（都市間コミューター路線の運航開始） | |
| 1993年（平成5年） | 11月29日 | SAAB340B型機シミュレーター 第1種フェーズ IIIの免許取得 |
| 1994年（平成6年） | 3月1日 | 指定定期航空運送事業者として認定を受ける |
| 1995年（平成7年） | 9月30日 | ドルニエ228型機退役 |
| 11月20日 | 総輸送旅客累計500万人を達成 | |
| 1997年（平成9年） | 7月14日 | 初の国際チャーター 鹿児島〜釜山線を実施（SAAB340B型機にて） |
| 1999年（平成11年） | 10月15日 | 総輸送旅客累計1,000万人を達成 |
| 2000年（平成12年） | 3月26日 | ｢子供と空と夢をつなぐ｣をテーマに、地域密着型イベント｢JACフェスティバル｣を開催 |
| 5月24日 | イメージキャラクター ｢ルリー｣誕生 | |
| 2001年（平成13年） | 2月9日 | 本社を現在地に移転 |
| 8月29日 | YS-11型機の後継機にカナダ・ボンバルディア社製DASH8-400型機（通称：Q400）の導入を決定 | |
| 2002年（平成14年） | 10月7日 | Q400型機 1号機到着 |
| 2003年（平成15年） | 2月1日 | Q400型機 1号機 大阪〜鹿児島線、大阪〜出雲線に就航 |
| 7月1日 | 創立20周年 | |
| 9月8日 | 総輸送旅客累計1,500万人を達成 | |
| 12月6日 | 奄美空港にて、第4回｢JACフェスティバル｣開催 | |
| 2004年（平成16年） | 12月16日 | YS-11型機総輸送旅客累計1,000万人を沖永良部〜鹿児島線で達成 |
| 2005年（平成17年） | 8月1日 | 客室乗務員、整備士制服一新（JALグループ統一） |
| 10月1日 | 運航乗務員制服一新（JALグループ統一） | |
| 10月5日 | Q400型機総輸送旅客累計100万人を出雲〜伊丹線で達成 | |
| 2006年（平成18年） | 4月11日 | 「ありがとう日本の翼YS-11キャンペーン」を展開 |
| 8月31日 | 幸せを運ぶ特別塗装機 JACコウノトリ夢ひこうき就航 | |
| 9月30日 | YS-11型機ラストフライト | |
| 2007年（平成19年） | 3月28日 | 総輸送旅客累計2,000万人を達成 |
| 7月1日 | JAC情報誌「JAC TIMES UPROP」創刊 | |
| 2008年（平成20年） | 4月1日 | 「JAC創立25周年キャンペーン」を展開 |
| 7月1日 | 創立25周年 | |
| 2009年（平成21年） | 9月1日 | 大阪〜屋久島線を開設 |
| 2010年（平成22年） | 3月29日 | 総輸送旅客累計2,500万人を達成 |
| 7月21日 | COP10 エコ・ハッピーターン号 就航 | |
| 11月28日 | 「JACフェスティバル in 奄美」開催 | |
| 2011年（平成23年） | 3月27日 | 福岡〜屋久島・福岡〜奄美大島の直行便を開設 |
| 11月20日 | 「JACフェスティバル in 徳之島」開催 | |
| 2012年（平成24年） | 3月25日 | 福岡−高知線を開設 |
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